专利合同纠纷案的解决方法主要包括：
1、双方当事人经协商解决；
2、通过向有管辖权的提起诉讼来解决。
未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决。专利纠纷当事人不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民起诉。
一、产品外观专利侵权
产品外观专利侵权的，人民或者管理专利工作的部门可以要求专利权人或者利害关系人出具由专利行政部门对相关实用新型或者外观设计进行检索、分析和评价后作出的专利权评价报告，作为审理、处理专利侵权纠纷的证据；专利权人、利害关系人或者被控侵权人也可以主动出具专利权评价报告。侵犯专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民起诉，也可以请求管理专利工作的部门处理。
二、外观专利侵权赔偿标准是什么
专利侵权赔偿有五种计算方法，具体如下：
1、权利人的损失，权利人的损失可按侵权造成的销量减少总额，乘以每个专利产品的合理利润之积；
2、侵权人获利，侵权产品在市场上销售的总数，乘以每个侵权产品的合理利润收入；
3、许可费的合理倍数，损失或利益难以确定，有许可费参照；
4、根据专利权类型、侵权性质和情节、专利许可性质、范围、时间等，确定赔偿金额；
5、无参照或明显不合理的，赔偿金额按照法律确定。
《中华人民共和国专利法》规定，未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民起诉，也可以请求管理专利工作的部门处理。
三、《中华人民共和国专利法》中的相关规定
(1)未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民起诉，也可以请求管理专利工作的部门处理。管理专利工作的部门处理时，认定侵权行为成立的，可以责令侵权人立即停止侵权行为，当事人不服的，可以自收到处理通知之日起十五日内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民起诉；侵权人期满不起诉又不停止侵权行为的，管理专利工作的部门可以申请人民强制执行。进行处理的管理专利工作的部门应当事人的请求，可以就侵犯专利权的赔偿数额进行调解；调解不成的，当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民起诉。
(2)负责专利执法的部门根据已经取得的证据，对涉嫌假冒专利行为进行查处时，有权采取下列措施：
(一)询问有关当事人，调查与涉嫌违法行为有关的情况；
(二)对当事人涉嫌违法行为的场所实施现场检查；
(三)查阅、复制与涉嫌违法行为有关的合同、、账簿以及其他有关资料；
(四)检查与涉嫌违法行为有关的产品；
(五)对有证据证明是假冒专利的产品，可以查封或者扣押。
管理专利工作的部门应专利权人或者利害关系人的请求处理专利侵权纠纷时，可以采取前款第(一)项、第(二)项、第(四)项所列措施。
负责专利执法的部门、管理专利工作的部门依法行使前两款规定的职权时，当事人应当予以协助、配合，不得拒绝、阻挠。
【本文关联的相关法律依据】
《民事诉讼法》第二十三条
因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民管辖。
第一百一十九条
起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民受理民事诉讼的范围和受诉人民管辖。